Δύο καίριοι παράγοντες υπήρξαν καθοριστικοί για την εξάρθρωση της 17 Νοέμβρη, της οργάνωσης που σημάδεψε τη Μεταπολίτευση μέχρι την έκρηξη στον Πειραιά το 2002. Αυτοί αναδείχθηκαν στο τέταρτο μέρος του ντοκιμαντέρ του Αλέξη Παπαχελά: η δολοφονία του Βρετανού ταξίαρχου Στίβεν Σόντερς και η εμφάνιση ενός μυστηριώδους πληροφοριοδότη, γνωστού ως «κύριος Χ» ή «Κίτσος».
Ο «κύριος Χ» προσέγγισε ο ίδιος τον τότε και νυν υπουργό Προστασίας του Πολίτη, Μιχάλη Χρυσοχοΐδη, ξεκινώντας μια σειρά από συναντήσεις. Αν και δεν κατονόμασε ποτέ μέλη της οργάνωσης, παρείχε κρίσιμες πληροφορίες για τη δομή και τον τρόπο λειτουργίας της. Σύμφωνα με τις αναφορές, επρόκειτο για άτομο με βαθιά γνώση της εγχώριας τρομοκρατίας, που κατανόησε ότι η πορεία της οργάνωσης είχε φτάσει σε αδιέξοδο.
Παράλληλα, το όνομα του Αλέξανδρου Γιωτόπουλου κυκλοφορούσε εδώ και καιρό στους κύκλους των υπηρεσιών ασφαλείας ως πιθανός αρχηγός. Οι υποψίες ενισχύθηκαν με τη συστηματική μελέτη των προκηρύξεων, από τις οποίες προέκυπτε συντάκτης μορφωμένος, με γαλλική παιδεία και αντιστασιακό παρελθόν.
Ο τότε αρχηγός της ΕΛ.ΑΣ., Φώτης Νασιάκος, θυμήθηκε μια σύσκεψη λίγο πριν τα Χριστούγεννα του 2001, στην οποία συμμετείχαν ο Μιχάλης Χρυσοχοΐδης και αξιωματούχος των βρετανικών υπηρεσιών. Σε μια συμβολική «δοκιμή», συμφώνησαν να γράψουν το όνομα του αρχηγού: ο ένας έγραψε «Αλέξανδρος Γιωτόπουλος» και ο άλλος «ο αρχηγός της ΛΕΑ», αναφερόμενοι ουσιαστικά στο ίδιο πρόσωπο.
Την ίδια περίοδο, οι γαλλικές αρχές εντόπισαν φωτογραφία του Γιωτόπουλου, ενώ οι ελληνικές υπηρεσίες συγκέντρωναν στοιχεία για το παρελθόν του, συμπεριλαμβανομένων πληροφοριών για εκπαίδευση στην Κούβα. Ο Έλληνας πρέσβης ταξίδεψε στην Αβάνα, ενώ στην Αθήνα η Αντιτρομοκρατική επιχείρησε να εντοπίσει συγγενείς του, χωρίς επιτυχία.
Η έρευνα περιλάμβανε ακόμη και παρακολούθηση περίπτερων που πωλούσαν γαλλικές εφημερίδες, ελπίζοντας να τον εντοπίσουν. Ωστόσο, ο Γιωτόπουλος προμηθευόταν εφημερίδες από βιβλιοπωλείο στο κέντρο της Αθήνας.
Από την εξέταση αμερικανικών αρχείων προέκυψε και το όνομα του Βασίλη Τζωρτζάτου, ο οποίος είχε συλληφθεί στο παρελθόν για επίθεση κατά Αμερικανού. Ο Μιχάλης Χρυσοχοΐδης ανέφερε ότι η προσαγωγή του στην Αντιτρομοκρατική προκάλεσε αντιδράσεις και καταγγελίες για σκευωρία, οδηγώντας στην απελευθέρωσή του.
Ο Μιχάλης Χρυσοχοΐδης, παρόλο που είχε αναφέρει τον «κύριο Χ» στο βιβλίο του, δεν αποκάλυψε την ταυτότητά του ούτε τότε ούτε στο ντοκιμαντέρ. Οι επαφές του με τον υπουργό και τον Φώτη Νασιάκο ήταν συχνές, με τον Νασιάκο να τον αποκαλεί «Κίτσο».
Παράλληλα, ένας Αμερικανός πράκτορας που ήρθε σε επαφή με παλιούς συντρόφους του Γιωτόπουλου στη Γαλλία, εντόπισε τον Βίκτωρα Αναγνωστόπουλο, ο οποίος παρείχε πληροφορίες που ενίσχυσαν την υποψία ότι ο Γιωτόπουλος ήταν ο αρχηγός.
Καθοριστική υπήρξε η διεθνής συνεργασία μετά τη δολοφονία του Βρετανού ταξίαρχου Στίβεν Σόντερς το 2000. Οι βρετανικές αρχές συμμετείχαν ενεργά, συλλέγοντας πληροφορίες και καλλιεργώντας μια κοινωνική αντίδραση κατά της τρομοκρατίας. Ο Ντάνκαν Τζάρεντ, πρώην αξιωματούχος της βρετανικής Αντιτρομοκρατικής, τόνισε τη σημασία της ενεργού συμμετοχής της κοινωνίας στον αγώνα κατά της τρομοκρατίας, καλώντας τους πολίτες να παρέχουν ακόμη και τις πιο μικρές πληροφορίες.
Οι Βρετανοί εντόπισαν και λάθη στις έρευνες των ελληνικών αρχών, όπως η καθυστέρηση στη διαπίστωση της οπής από πολεμικό τυφέκιο στο αυτοκίνητο του Σόντερς. Μοίρασαν φυλλάδια σε διερχόμενους οδηγούς, ζητώντας παρατηρήσεις.
Στην κινητοποίηση της κοινωνίας συμμετείχαν η Εκκλησία, με τον Αρχιεπίσκοπο Χριστόδουλο να παρίσταται σε τελετή μνήμης, και η πρωτοβουλία συγγενών θυμάτων «Ως Εδώ».
Ο Μιχάλης Χρυσοχοΐδης ζήτησε τη συγκέντρωση όλων των στοιχείων σε μία συνολική αναφορά, δημιουργώντας την «έκθεση Νασιάκου», με σκοπό την αύξηση της πίεσης στα μέλη της οργάνωσης.
Ο χρόνος μετρούσε αντίστροφα. Η έκρηξη στον Πειραιά στις 29 Ιουνίου 2002 οδήγησε στην αποκάλυψη και εξάρθρωση της 17 Νοέμβρη, αποτέλεσμα της στενής συνεργασίας των Μιχάλη Χρυσοχοΐδη, Φώτη Νασιάκου, εισαγγελέα Ιωάννη Διώτη και διοικητή Αντιτρομοκρατικής Στέλιου Σύρρου.
Ο Ρόμπερτ Κλίφορντ, επικεφαλής του FBI στην Αθήνα (2000-2004), αποκάλυψε ότι ο ίδιος θα μπορούσε να είναι ένα από τα επόμενα θύματα της 17 Νοέμβρη, καθώς το προφίλ του είχε αναδειχθεί σημαντικά στην Ελλάδα.